À Daten City, entre Paradis et Enfer, de sinistres « fantômes » se nourrissent de désirs et ressentiment humains. Deux êtres mystérieux surgissent pour anéantir ces fantômes par leur lumière divine : Panty & Stocking.Les deux sœurs et anges déchus doivent débarrasser la Terre des ténèbres. Mais qui sont-elles ? Messagères de Dieu ou agents du Diable ? Les sœurs affrontent des forces surnaturelles.