Ageha Yoshina, un chico de instituto que, tras usar una misteriosa tarjeta telefónica, es transportado a un futuro desolado de la Tierra, un mundo apocalíptico llamado Psyren, donde descubre poderes psíquicos y debe sobrevivir en un juego mortal para desentrañar el misterio de cómo el mundo llegó a ese estado y salvar a su amiga desaparecida, todo mientras se enfrenta a una sociedad secreta con habilidades PSI.