Nils Holgersson est un jeune garçon paresseux qui aime jouer des mauvais tours. Un jour, un lutin lui lance un sort et le réduit à une taille minuscule, lui donnant aussi la capacité de parler aux animaux. Le sort sera levé quand Nils sera devenu une meilleure personne. Entraîné par le jars Martin à la suite d'un vol d'oies sauvages, il va découvrir son pays…